1. تهیه و تنظیم دستورالعملها و ارایه به ستاد مرکزی جهت تصویب

2. پیگیری مصوبات ابلاغی ستاد

3. مستندسازی فعالیتهای اردوهای جهادی

4. تهیه گزارش اردوهای جهادی وزارت بهداشت

5. تهیه و تنظیم شرح وظایف ساختار دبیرخانه ستاد و ارایه به ستاد جهت تصویب

6. اطلاع رسانی به اعضاء جهت شرکت در جلسات

7. تهیه صورتجلسات و ارسال آنها برای اعضای ستاد

8. انجام مکاتبات و پاسخگویی

9. پیگیری تشکیل شوراهای مربوطه به صورت منظم بر اساس دستورالعمل­های وزارتی و استانی.

10. تعامل و ارتباط با دبیرخانه­ های استانی و وزارتخانه متبوعه و پیگیری مکاتبات و انجام وظایف خواسته شده بر اساس برنامه های ابلاغی ستاد استانی و وزارتی.

11. برنامه­ ریزی در راستای برنامه عملیاتی وزارت و بارگذاری فعالیت­ها در سامانه عملیاتی.

12. فعال سازی هسته­ها و گروه­های جهادی در کلیۀ مراکز تابعه خصوصاً مراکز آموزشی ، درمانی و بهداشتی.

14. پیگیری و رسیدگی به شکایات مربوطه.

15. انجام سایر امور محوله.