۱. تهیه و تنظیم دستورالعملها و ارایه به ستاد مرکزی جهت تصویب
۲. پیگیری مصوبات ابلاغی ستاد
۳. مستندسازی فعالیتهای اردوهای جهادی
۴. تهیه گزارش اردوهای جهادی وزارت بهداشت
۵. تهیه و تنظیم شرح وظایف ساختار دبیرخانه ستاد و ارایه به ستاد جهت تصویب
۶. اطلاع رسانی به اعضاء جهت شرکت در جلسات
۷. تهیه صورتجلسات و ارسال آنها برای اعضای ستاد
۸. انجام مکاتبات و پاسخگویی
۹. پیگیری تشکیل شوراهای مربوطه به صورت منظم بر اساس دستورالعملهای وزارتی و استانی.
۱۰. تعامل و ارتباط با دبیرخانه های استانی و وزارتخانه متبوعه و پیگیری مکاتبات و انجام وظایف خواسته شده بر اساس برنامه های ابلاغی ستاد استانی و وزارتی.
۱۱. برنامه ریزی در راستای برنامه عملیاتی وزارت و بارگذاری فعالیتها در سامانه عملیاتی.
۱۲. فعال سازی هستهها و گروههای جهادی در کلیۀ مراکز تابعه خصوصاً مراکز آموزشی ، درمانی و بهداشتی.
۱۴. پیگیری و رسیدگی به شکایات مربوطه.
۱۵. انجام سایر امور محوله.